深圳东站建筑风格以“布吉河”为主题，采用大型落地玻璃，站房顶棚为波浪形，车站集铁路、地铁、公交和社会车辆等为一体。
深圳东站是布吉综合客运枢纽重要组成部分，是深圳市“两主三辅”铁路车站之一，其功能定位仅次于深圳站、深圳北站，是深圳地区第三大铁路客运枢纽。