由禅僧从秦汉传播到日本寺庙，所以纳豆首先在寺庙得到发展是以亦称唐纳豆或咸纳豆，随后依当地环境，如日本不用豆豉而用大酱，或用酱油不用豉汁，在日本更基于各地区特色，传承出诸如大龙寺纳豆、大德寺纳豆、一休纳豆，大福寺的滨名纳豆悟真寺的八桥纳豆等等地方特产。