臭氧抗菌剂的安全性比较高，属于无毒级，并且对皮肤、粘膜、眼等刺激作用很小，由于健康细胞具有强大的氧化平衡酶系统，因而对健康细胞无害。使用时，根据个人体质，有时会出现轻微的疼痛。臭氧是强氧化剂。能在接触瞬间把组成微生物和病毒蛋白体中的C．H．N等元素氧化分解，达到灭菌杀毒效果。对于人体而言，臭氧是一种有毒的气体，它有许多与氧气不同的化学和毒理方面的性质，具有刺激气味和极强的氧化性质。
它是强氧化剂，就会刺激粘膜，在一些臭氧治疗以后有一点点刺痛这是正常的，慢慢的疼痛就会减轻，尽量的少活动多卧床休息，做完臭氧治疗以后，需要休息一下才能够恢复，如果疼痛严重的话就需要到医院进一步复查。