法律主观。被告公司一般不可以注销。由于被告公司在进行诉讼时，权利义务关系尚未明确，公司的清算组也不能准确的确定公司的资产和债权债务情况，所以要等诉讼结束后，公司经依法清算，才能申请办理注销登记。