用人单位不能以超过仲裁时效为理由拒付工伤赔偿金。根据劳动争议处理条例，双方可协商解决劳动争议，达成赔偿协议后可直接起诉，不受仲裁时效限制。工伤赔偿私了协议无效的情况包括在未经认定和鉴定前做出协议、存在不公平、误解或欺诈情况，以及违反工伤保险条例。签订的工伤赔偿协议具有约束力，不履行可起诉追究法律责任。法律分析；用人单位以超过仲裁时效的理由推托拒付工伤赔偿金的理由是不成立的。《中华人民共和国劳动争议处理条例》第六条规定：“劳动争议发生后，当事人应当协商解决；不愿协商或者协商不成的，可以向本企业劳动争议调解委员会申请调解；调解不成的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。当事人也可以直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对仲裁裁决不服的，可以向人民法院起诉。”。