1、计算方式不同。6%的税率是一般纳税人按照取得的全部价款和价外费用为销售额，按照一般计税方法计算缴纳的增值税；5%的税率适用于差额纳税方式，即以取得的全部价款和价外费用，扣除代用工单位支付给劳务派遣员工的工资、福利和为其办理社会保险及住房公积金后的余额为销售额，按照简易计税方法计算缴纳的增值税。2、可抵扣性不同。6%的税率可以抵扣进项税额；5%的税率则不能抵扣进项税额。3、征税对象不同。6%的税率征税对象是劳务派遣公司；5%的税率征税对象是劳务派遣员工。4、影响税务负担不同。6%的税率直接影响劳务派遣公司的盈利水平；5%的税率直接影响劳务派遣员工的实际收入水平。