1、归属和管理单位不同。国管公积金由中央国家机关住房资金管理中心或中央国家机关住房资金管理中心负责管理，通常适用于中央国家机关、在京单位等的在职员工；市管公积金由各地的住房公积金管理中心负责管理，适用于地方省市单位、城镇企业、事业单位等的在职员工。2、缴存比例和上限不同。国管公积金的缴存比例和缴存上限通常由中央政府规定；市管公积金的缴存比例和缴存上限则根据当地政策确定。3、使用范围不同。国管公积金可以跨地区使用，适用于全国范围内的单位和个人；市管公积金通常仅限于公积金缴纳地的使用。4、信用评级不同。国管公积金通常没有信用评级；市管公积金则有信用评级，信用评级越高，贷款额度也越高。