当已知基因名或ID时,可通过NCBI搜索基因序列。首先登陆NCBI官网,在下拉菜单选择gene,搜索基因名或ID。NCBI:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/这里选取一个调节根系发育的基因AT5G61350进行示例。在生物信息学中,FASTA格...
直接在NCBI主页输入你要找的基因的名字,比如S1PR1,然后搜索,找到下面的内容:Genes90Gene:collectedinformationaboutgeneloci1HomoloGene:homologousgenesetsforselectedorganisms12UniGene:clustersofexpres...
基因的pomoter区域:首先在NCBI中查找基因id,显示location的位置;该位置对应到转录水平,应该是从TTS(即5'UTR的起始);一般取上游2K长的序列作为该基因的promoter(Note:要注意该基因位于+/-链上)reference: ...
网站一:根据基因的名字查找基因序列https://www.ncbi.nlm.nih.gov/NCBI--选择Gene--输入基因名字--search网站二:根据基因的Loc号码查找基因的序列(水稻)在该网站http://rice.plantbiology.msu.edu/主页,Analy...
有关Acembly的更多信息可以在NCBI的网站找到(http://www.ncbi.nih.gov/IEB/Research/Acembly/)。EnsemblGenePredictions路径由Ensembl提供。Ensembl基因通过许多方法来预测,包括与已知mRNA和蛋白质进行同源性比较,ab...
1、首先输入基因的完整学名,找到与基因相关的cDNA序列.在这一cRNA序列的解说信息里,就已经有各外显子的分节.2、将该cDNA输入Blast进行序列比对,就可以找到其每一个外显子所对应的染色体位置,这些信息就显示了所有的外显子...
首先选择Gene的标签,输入基因名,然后点击搜索,然后出来一大堆基因,选择你的那个物种的基因,点击,进去看一下,选择Mapviewer然后找到序列,选择基因的外显子上游2000bp,下载。。。
事实上,在NCBI有很多种办法可以确定某个基因的外显子或者内含子,当然还有UTR区域。今天我们来介绍NCBI的其中一个使用软件Splign来在NCBI上找到一个基因的外显子和内含子。操作步骤如下:1.在Gene数据库,填入基因名HNF-4...
一般的来说,在NCBI上查到的基因序列,一般是指的基因的mRNA(cDNA)序列,这个里面,并没有启动子、终止子,增强子这类的信息,你需要通过blast等手段,将染色体上的序列找到,然后使用对应的软件进行分析,从而得到一个初步...
先分析启动子可能位置,再确定ORF。你可以把你克隆的片段上游2k以内的序列,用一些启动子分析软件找下,分析下可能的转录起始位点,再在下游找合适大小的起始密码子与终止密码子片段。提供一个简单的promoter查找在线工具。http...