法律分析：如果公司不认可员工的工伤是工伤，员工可以通过申诉的方式维护自己的合法权益。根据我国《工伤保险条例》的规定，只要是工作中受伤或者患病的，都可以认定为工伤。如果公司不认可员工的工伤是工伤，员工可以采取以下措施：
1. 向公司申请认定工伤，提供相关资料和证据；
2. 如果公司拒绝认定，可以向劳动保障部门投诉；
3. 如果仍然无法解决问题，可以通过诉讼的方式申诉。
法律依据：
1. 《中华人民共和国工伤保险条例》第十六条：“本条例所称工伤，是指在工作期间，因工作原因受到的伤害、职业病。”
2. 《中华人民共和国劳动合同法》第四十三条：“用人单位违反本法规定，侵犯劳动者合法权益的，由劳动行政部门责令改正，给予警告，并可以责令支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可以责令支付赔偿金。”
3. 《中华人民共和国民事诉讼法》第五十四条：“当事人认为人民法院对本案的管辖权有异议，应当在提交答辩状或者开庭前提出；逾期则视为放弃管辖权异议权。”
总之，员工应该及时维护自己的合法权益，如果公司不认可员工的工伤是工伤，员工可以通过申诉的方式维权，同时应该了解和掌握相关法律知识，对维权过程中的法律问题有所准确判断。
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