NoteExpress好。
1、NoteExpress有全中文界面，用户较容易学习入门。
2、NoteExpress支持在同一个参考文献数据库中建立目录，按照目录管理参考文献，Endnote不支持此项功能。
3、NoteExpress支持笔记功能，可以随时对感兴趣的参考文献作别笔记，并可进行分类管理，Endnote不支持此功能。
4、将NoteExpress快捷方式做进鼠标右键快捷菜单中，可以随时将正在浏览的网页内容下载到本地，并放进“笔记”分类目录中进行管理，Endnote不支持此功能。
5、NoteExpress提供相关检索历史保存功能，Endnote不支持此功能。
6、个人制作数据库过滤器时稍复杂，NoteExpress不如EndNote容易上手。总结以上优点缺点得出NoteExpress比EndNote好。
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