应当运用 证据 证明的案件事实包括： (一)被告人、被害人的身份; (二)被指控的犯罪是否存在; (三)被指控的犯罪是否为被告人所实施; (四)被告人有无刑事责任能力，有无罪过，实施犯罪的动机、目的; (五)实施犯罪的时间、地点、手段、后果以及案件起因等; (六)被告人在 共同犯罪 中的地位、作用; (七)被告人有无从重、从轻、减轻、免除处罚情节; (八)有关附带民事 诉讼 、涉案财物处理的事实; (九)有关 管辖 、回避、 延期审理 等的程序事实; (十)与定罪量刑有关的其他事实。 认定被告人有罪和对被告人从重处罚，应当适用证据确实、充分的证明标准。 《中华人民共和国 刑事诉讼法 》第六十四条 对于危害国家安全犯罪、恐怖活动犯罪、黑社会性质的组织犯罪、 毒品犯罪 等案件， 证人 、鉴定人、被害人因在诉讼中作证，本人或者其近亲属的人身安全面临危险的，人民法院、人民检察院和公安机关应当采取以下一项或者多项保护措施： (一)不公开真实姓名、住址和工作单位等个人信息; (二)采取不暴露外貌、真实声音等出庭作证措施; (三)禁止特定的人员接触证人、鉴定人、被害人及其近亲属; (四)对人身和住宅采取专门性保护措施; (五)其他必要的保护措施。 证人、鉴定人、被害人认为因在诉讼中作证，本人或者其近亲属的人身安全面临危险的，可以向人民法院、人民检察院、公安机关请求予以保护。 人民法院、人民检察院、公安机关依法采取保护措施，有关单位和个人应当配合。
《最高人民法院关于适用中华人民共和国刑事诉讼法的解释》第七十二条 应当运用证据证明的案件事实包括： （一）被告人、被害人的身份； （二）被指控的犯罪是否存在； （三）被指控的犯罪是否为被告人所实施； （四）被告人有无刑事责任能力，有无罪过，实施犯罪的动机、目的； （五）实施犯罪的时间、地点、手段、后果以及案件起因等； （六）是否系共同犯罪或者犯罪事实存在关联，以及被告人在犯罪中的地位、作用； （七）被告人有无从重、从轻、减轻、免除处罚情节； （八）有关涉案财物处理的事实； （九）有关附带民事诉讼的事实； （十）有关管辖、回避、延期审理等的程序事实； （十一）与定罪量刑有关的其他事实。
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