新生儿可以参加新型农村合作医疗报销。是有条件的。只要新生儿是在出生3个月以内申报登记新型农村合作医并缴费的，其在申报前发生的医疗费用，市社保中心都视同其已经参保并给予医疗报销政策享受的待遇。
所以;你应该在宝宝出生后的3个月之内申报登记新型农村合作医并缴费，宝宝之前发生的医疗费用就可以报销。对于出生后超过3个月以上才参保缴费的，仍按自缴费次月起享受医疗保险待遇的规定执行。
住院报销须注意：住院时使用新生儿的名字，尽量避免使用“某某之子”或“某某之女”的名字;告知医生已参加新农合医保，尽量使用医保报销目录内药物和治疗方式，少使用自费药品。
参保后新生儿需住院的，须在住院时持“住院证”到参保的人力资源社会保障服务中心开具无卡证明，并交至医院医保办，住院时凭无卡证明办理住院手续。出院结算时，使用医保结算系统结算，只支付个人自负部分。
法律依据
《中华人民共和国社会保险法》
第二十八条 符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。
第二十九条 参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位直接结算。
社会保险行政部门和卫生行政部门应当建立异地就医医疗费用结算制度，方便参保人员享受基本医疗保险待遇。
第三十条 下列医疗费用不纳入基本医疗保险基金支付范围:
（一）应当从工伤保险基金中支付的；
（二）应当由第三人负担的；
（三）应当由公共卫生负担的；
（四）在境外就医的。
医疗费用依法应当由第三人负担，第三人不支付或者无法确定第三人的，由基本医疗保险基金先行支付。基本医疗保险基金先行支付后，有权向第三人追偿。
