过路费抵扣进项税额的流程如下：
1、在购买过路费时，需要索取发票或购置凭证作为支持材料，以便后续抵扣；
2、在企业所得税汇算清缴时，可以将已经购买过路费的金额作为成本进行扣除；
3、根据国家相关规定，企业所得税汇算清缴时可以将过路费支出的50%作为所得减免项目进行抵扣。企业需要在企业所得税汇算清缴时填报《企业所得税年度纳税申报表》，并在其中填报过路费的支出金额，以便享受企业所得税的减免优惠。
过路费抵扣进项税额的立案标准：
1、高速公路和其他收费公路：高速公路和其他收费公路的过路费均可列入进项税额抵扣范围内；
2、普通公路：普通公路过路费的抵扣标准和金额由各省、自治区、直辖市税务局自行确定。
综上所述，企业在申报过路费支出时，应当保证所填金额的准确性，并确保所提供的发票或购置凭证等支持材料真实有效。
【法律依据】：
《中华人民共和国增值税暂行条例》第八条
纳税人购进货物、劳务、服务、无形资产、不动产支付或者负担的增值税额，为进项税额。
下列进项税额准予从销项税额中抵扣：
（一）从销售方取得的增值税专用发票上注明的增值税额。
（二）从海关取得的海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额。
（三）购进农产品，除取得增值税专用发票或者海关进口增值税专用缴款书外，按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和11%的扣除率计算的进项税额，国务院另有规定的除外。进项税额计算公式：
进项税额=买价*扣除率
（四）自境外单位或者个人购进劳务、服务、无形资产或者境内的不动产，从税务机关或者扣缴义务人取得的代扣代缴税款的完税凭证上注明的增值税额。
准予抵扣的项目和扣除率的调整，由国务院决定。
