一、异地住院农村合作医疗备案的方法为：
1、首先确认是省内异地就医还是跨省异地就医，如果是前者则不需要备案；
2、如果是跨省异地就医，参保人在参保市医疗保险经办机构办理异地就医备案手续,并领取《异地就医备案表》；
3、参保人持《备案表》,至联网医院就医；
4、如需住院,参保人持异地就医备案表和住院通知单至医院医保办窗口办理住院手续,按总费用的30%-40%交付住院押金；
5、出院审核结算。个人承担自负部分,其余应由统筹金支付的部分由医院记账；
6、出院结算手续办理完毕后,参保人持《异地就医医保费用明细单》出院,《备案表》留医院存档。
此外,异地安置人员需要住院的,应该通过电话等方式在所在医疗保险经办机构办理备案手续,然后持本人社保卡(证)及身份证办理就医住院手续,其它就医流程与转诊人员就医流程相同。
二、异地备案需要什么证明：
1、驻地公安机关办理的有效居住证明；
2、社会保障卡及复印件；
3、转诊转院确定表；
4、收治医院出具的病情介绍资料。
三、其他注意事项：
1、异地就医一般只能报销住院费和急诊费，只有少数城市可以报销结算门诊费用；
2、异地就医的报销范围和报销比例：以就医地医保目录为准，如药品、医疗设备、诊疗项目、服务设施等，需要纳入就医地医保目录才可以。报销比例以参保地政策为准，包括起付线、报销比例、报销限额等等。
3、如果是支持异地直接结算的医院，在办理出院手续时，在结算窗口就可以直接完成结算。如果遇到特殊情况，比如系统故障等，那么还是需要带上就诊资料，回参保地完成报销。
法律依据：
《社会保险法》
第四条中华人民共和国境内的用人单位和个人依法缴纳社会保险费，有权查询缴费记录、个人权益记录，要求社会保险经办机构提供社会保险咨询等相关服务。
个人依法享受社会保险待遇，有权监督本单位为其缴费情况。
