在医学上进行亲子鉴定并非难事，关键是，在诉讼中如何应用亲子鉴定的问题。亲子鉴定涉及婚姻、家庭、子女人身权利和财产权益，在诉讼中适用应贯彻的是稳定、谨慎之精神，其适用是有条件的，在法律没有具体规定前提下，笔者认为，应以《批复》有关规定为基础，严格掌握其适用原则。
1．当事人意志因素制约。《批复》规定：对于双方当事人同意作亲子鉴定的，一般应准许；一方当事人要求作亲子鉴定，或者子女超过3周岁的应视具体情况从严掌握，对其中必须作亲子鉴定的也要做好当事人及有关人员的思想工作。根据这一规定精神，笔者认为：
(1)双方当事人一致同意作亲子鉴定的应准许：
(2)丈夫无证据猜疑妻子作风不正而要求作亲子鉴定，妻子拒绝的，不得强制作亲子鉴定：
(3)子女已长大成年，父或母一方要求作亲子鉴定无足够证据或虽有证据而另一方或子女否认，坚决不同意作亲子鉴定的，不能强制作亲子鉴定。如本案被告喻乙不同意作亲子鉴定，就是应当考虑的因素。
2．保护妇女、儿童权益原则。《批复》规定：对要求作亲子鉴定的案件，应当从保护妇女、儿童合法权益，有利于增进团结利防止矛盾激化出发，区别情况，慎重对待。第一，当亲子鉴定的适用可能影响子女或妇女合法权益而带来不良后果时，一般不应适用：第二，在未婚男女、未婚男子(女子)与已婚女子(男子)发生性关系下所生子女因抚育费纠纷、赔偿纠纷引起的亲子关系确认案件中，任何一方要求均可准许；第三，因婴儿抱错、怀疑非自己所生婴儿而拒绝从医院抱领的，任何一方要求均可启动亲子鉴定程序。这些基于未成年人利益而申请亲子鉴定无需考虑对方意志，这一点在司法实践中已被贯彻。
3．亲子鉴定提起的时效限制。虽然《批复》对于亲子鉴定的适用有所涉及，但很有限。对于亲子鉴定提起的时效问题未作出相应的规定。从国外立法看，德国民法典规定，否定父子关系，只能在得知子女出生之日起2年内提出。对于子女成年后的否认，应在成年后的两年内提出。《瑞士民法典》对该诉讼时效规定的最为完善：“夫在知悉生育及知悉本人并非子(女)之父或第三人在受胎期间与其同居的事实之后，得在一年的期限内起诉。超过出生后5年，诉权自行失效。”笔者认为，我国在处理相关问题时，立法及司法实践中应当借鉴上述规定进行处理。笔者建议，可以引入两年时效制度，当得知或应当得知子女非自己亲生之日起无正当理由两年内不主张确认权利者，诉权自行消失。这样，有利于保护妇女、儿童的合法权益，维护婚姻、家庭秩序的稳定。
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