刑事赔偿程序是指解决刑事赔偿纠纷所应遵循的程序，是刑事司法侵权受害人实现刑事赔偿请求权的方式、方法和步骤。“程序法规范虽然不直接规定当事人的实体权利和义务，但实体法规范必须借助于程序法规范才能实现，因此可以说，没有程序就没有权利。”所以，从刑事赔偿程序的价值意义上讲，刑事赔偿程序不仅仅是国家刑事赔偿责任的实现过程，更是受害人所受损害得以救济的过程。法律规定赋予了公民某种权利，却没有规定实现此种权利的途径和保障措施，那么这种权利就形同虚设。刑事赔偿程序的设置一方面对刑事赔偿义务机关行使职权进行约束，另一方面为受害人实现合法权益提供了有效保障和制度依靠。正因为如此，刑事赔偿程序的重要性并不亚于刑事赔偿归责原则、刑事赔偿范围等实体性问题。“虽然赔偿范围窄、赔偿标准低、但如果赔偿程序完善，我们至少还能够保障‘低水平的正义’;如果赔偿程序也不完善，那么，连‘低水平的正义’都可能无法实现。”
(一)我国刑事赔偿程序的特点。由于各国的政治体制、法律制度以及文化传统等存在差异，表现在刑事赔偿立法上也各有特点。我国刑事赔偿程序有以下特点。
一是刑事赔偿程序和行政赔偿程序一并规定在《国家赔偿法》中，并且刑事赔偿程序适用行政赔偿程序的部分规定。
二是刑事赔偿只能单独提出。有别于国家赔偿法和行政诉讼法对行政赔偿的规定，国家赔偿规定刑事赔偿只能单独提出，进行司法侵权确认，然后进入先行处理程序。
三是先行处理程序、复议程序为必经程序(如果法院是赔偿义务机关，则直接进入决定程序)，否则刑事赔偿程序无法继续进行，复议实行一级复议制。
四是采用国际通行原则，法院终局解决刑事赔偿纠纷。先行处理程序之后，争议仍然存在，受害人进入复议程序(如果法院是赔偿义务机关，则直接进入决定程序)，如果还有异议，则请求法院赔偿委员会作出终局决定，受害人不再有其他救济途径，缺乏应有的监督制约程序。
五是法院赔偿委员会解决刑事赔偿纠纷适用决定程序，不适用诉讼程序，采用书面审查，不开庭、不辩论。
我国刑事赔偿程序的这些特点，恰恰是我国刑事赔偿程序的缺陷。“我国现行赔偿法真正问题的症结可能并不在于强调令行禁止、正名定分的实体问题的缺失和落后，相反，恰恰是程序要件的缺失、程序可操作性低、程序设计不合理、程序机制的失效、赔偿责任主体和义务主体混淆等问题造成了现行国家赔偿法制度的‘整体失灵’”。
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