夫妻双方感情破裂请求离婚，一方对子女是否亲生有疑问的，即可以请求做离婚亲子鉴定。但是，另一方不同意鉴定的话，将会直接影响离婚子女的判断。那么，在这个情况下法院会怎么处理？首先看司法实践中对亲子鉴定的做法。
根据相关离婚法律的规定，并没有明确表明对离婚亲子鉴定的态度，但是法院在审理离婚案件时，是以当事人自愿为原则，所以夫妻双方请求离婚，一方主张做离婚亲子鉴定，而另一方不同意的，法院将不会准许做亲子鉴定。
不过，虽然不能通过做离婚亲子鉴定，从而直接判断孩子是否属于婚生子等，但主张鉴定的一方可以通过举证，提供能够证明孩子属于非婚生等的证据，接着让法院进行推定得出结论。
具体而言，主张做鉴定的一方可以从以下方面举证：
1、提供夫妻双方和子女的血型证据
因为根据血型遗传的规律，也能直接否定亲子关系，比如最为特殊的O型血，父母双方都是O型血，那么从血型匹配的结论看，其子女不可能有A型血。
不过，这是从医学的角度分析，具体还是可以通过做亲子鉴定，得出最为科学合理的结论。
2、提供无生殖能力的医学鉴定结论
如果医学鉴定有生殖能力上的残疾，那么即可以此作为推定的证据。
3、怀孕时双方是否有同居的证据
对于这点，实践中还是比较难确认的，但是因为同居怀孕生子，一方拒绝做亲子鉴定的，法院可以推定为证据成立。
4、跟子女外貌特征的不同的证据
不过，因为遗传的特殊性，所以要以这个为证据，最终需要获取其他更有力的证据做判断。
最后，实践中做离婚亲子鉴定，遭到一方的拒绝的话，其实可以通过以上的证据证明。不过去收集整理的证据是否有直接的作用，建议可以在必要的时候找个专业律师协助。
一、父子关系异议申请亲子鉴定中一方拒绝可以吗
申请亲子鉴定遭拒还可以认定父子关系。
根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民法典〉婚姻家庭编的解释（一）》第三十九条规定，父或者母向人民法院起诉请求否认亲子关系，并已提供必要证据予以证明，另一方没有相反证据又拒绝做亲子鉴定的，人民法院可以认定否认亲子关系一方的主张成立。
父或者母以及成年子女起诉请求确认亲子关系，并提供必要证据予以证明，另一方没有相反证据又拒绝做亲子鉴定的，人民法院可以认定确认亲子关系一方的主张成立。
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