一、劳动合同纠纷社保问题处理
法院没有认定解除劳动关系，单位应该支付由单位应当承担的社保份额。
根据《劳动合同法》第四十八条规定，劳动者要求继续履行劳动合同的，用人单位应当继续履行劳动合同，双方劳动关系依然存续;劳动者不要求继续履行劳动合同或者劳动合同已经不能继续履行的，劳动者明示不要求继续履行劳动合同或者确认劳动合同已经不能继续履行的时间即为劳动合同的解除时间。劳动者违法解除劳动合同，对用人单位不产生解除劳动合同的效力，用人单位同意解除或根据规章制度规定解除劳动合同的时间为劳动合同的解除时间。
所以，只要法院没有认定解除劳动关系，单位应该支付由单位应当承担的社保份额。
二、劳动合同纠纷找谁投诉
一般劳动合同纠纷的解决方式有向当地的劳动监察部门进行投诉举报或者申请劳动仲裁。
1、劳动者可以到当地劳动局劳动监察投诉;优点：方式简单。缺点：各地执法力度可能不是很大;
2、可以到当地劳动局(人力资源和社会保障局劳动争议仲裁委员会)申请仲裁，要求支付工资。如果未签订劳动合同，可以要求支付未签订劳动合同的双倍工资。如果是以拖欠工资提出的解除劳动关系，还可以要求支付经济补偿金。优点：除了工资外，还可以主张经济补偿、双倍工资等，并且一般都可以最终解决;缺点：申请劳动仲裁就是打劳动官司，程序稍多，需要专业人士指导。
三、劳动合同纠纷仲裁时效
中华人民共和国劳动争议调解仲裁法第二十七条规定：劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。前款规定的仲裁时效，因当事人一方向对方当事人主张权利，或者向有关部门请求权利救济，或者对方当事人同意履行义务而中断。从中断时起，仲裁时效期间重新计算。
因不可抗力或者有其他正当理由，当事人不能在本条第一款规定的仲裁时效期间申请仲裁的，仲裁时效中止。从中止时效的原因消除之日起，仲裁时效期间继续计算。劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受本条第一款规定的仲裁时效期间的限制;但是，劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。
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