(1)保密费和经济补偿应单独列支，不可取代。
(2)约定竞业禁止条款。为了有效保护商业秘密，保密协议中一般应当设计竞业禁止条款，对核心员工流动作出约定。如禁止核心员工到同行业且有竞争关系的企业担任相关职位，期限最长不超过3年等。
(3)应分人分岗签订保密协议。需要注意的是，与约定竞业禁止企业必须支付员工补偿金不同，要求职工保密企业可以给予该职工一定数额的经济补偿，也可以不给经济补偿。无论企业是否给予经济补偿，只要签订了保密协议，员工就必须履行保密的义务。
一、企业如何约定竞业禁止
企业在运用竞业禁止条款进行自我保护时，要注意以下几个问题：
1、有相应规定或协议的企业，一定要将条款尽量细化。在条款设置时要考虑全面，将所有可能性都考虑进去，落实到纸面上。
2、明确竞业补偿金问题。获得补偿是执行竞业禁止条款的前提，有部分企业对于竞业补偿金的问题上常与职工产生矛盾，往往在员工离职后不愿支付相应的竞业补偿金。可一旦发生纠纷，员工就可以企业未支付补偿金为由自由离职。关于竞业补偿金，法律上并没有明文规定支付的具体金额。
3、在条款制定时，要注意注明，一旦员工违反竞业禁止条款合同后该如何处理。一般企业都没有将违反后的相应处理方法注明在条约中，而是与员工有过口头协议，这在法律上是站不住脚的。
4、在员工入职、进入核心岗位之前就应该与其签订竞业禁止合同，而不是在其提出离职后再补签。
二、离职后没有补偿金，保密协议是否有效
补偿金是对竞业禁止协议的，如果竞业限制期内单位不支付补偿金，劳动者可以不履行竞业禁止协议。
保密协议不是必须有补偿金。
【法律依据】
《劳动合同法》第二十三条用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守用人单位的商业秘密和与知识产权相关的保密事项。
对负有保密义务的劳动者，用人单位可以在劳动合同或者保密协议中与劳动者约定竞业限制条款，并约定在解除或者终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。劳动者违反竞业限制约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。
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