技术合同认定是指法人、个人和其他组织按照国家有关规定，依法订立的技术开发合同、技术转让合同、技术咨询合同和技术服务合同。技术合同必须备案，签订技术合同的双方当事人都是需要备案的。具体流程是：
(一)卖方用户注册
买方凭真实、有效证件到登记机构注册或自行注册。首次申请认定登记的卖方，需在广东省科技业务综合管理系统注册、上传法人证书、营业执照、企业信息表并选择技术合同认定登记点进行申报。
(二)网上申报登记
卖方根据技术合同内容，在“广东省科技业务综合管理系统”技术合同登记业务系统，凭用户名和密码登录后填“登记申请书”并提交，也可以有选择的技术合同认定登记机构进行登记。
(三)报送合同文本
卖方按申报材料要求，将技术合同和其他附件材料报送选定的技术合同登记机构审核。注:设计专利技术合同的，直接向国家知识产权局专利局广州代表处申请认定登记。
(四)审核登记
登记员查阅卖方网上“登记申请书”并根据卖方送审合同文本材料进行审核、认定登记、盖章，出具认定登记证明。(由市级登记机构初审核盖章，并送审计科技部门审核盖章)
(五)卖方办理减免税
卖方凭核定后的技术合同认定登记证明，到企业所在税务部门办理免税或退税手续(保税办理程序见手册)
一、高新科技企业申报
1、企业进行自我评价。企业在申请高新技术企业认定之前应认真阅读相关文件和认定标准，客观进行自我评价。认为符合认定条件的，则可在高新技术企业认定管理工作网上进行企业注册登记。
2、进行网上注册登记。企业登录高新技术企业认定管理工作网，填写注册登记表，将填好的注册登记表发至认定机构。认定机构完成企业身份确认，并将用户名和密码通过网络告知企业。
3、企业提交认定申请。企业根据自己的用户名和密码进入网上认定管理系统，填写高新技术企业认定申请书发至认定机构，并将规定的申请材料提交认定机构。
4、认定机构组织认定。认定机构收到企业完整的申请材料后，组织专家审查，专家组长汇总各位专家分数，按分数平均值填写《高新技术企业认定专家组综合评价表》（附件5）。具备条件的地区可进行网络评审。认定机构结合专家组评审意见，对申请企业申报材料进行综合审查（可视情况对部分企业进行实地核查），提出认定意见，确定认定高新技术企业名单，报领导小组办公室备案，报送时间不得晚于每年11月底。
5、公示和颁发认定证书。经认定报备的企业名单，由领导小组办公室在高新技术企业认定管理工作网公示10个工作日。无异议的，予以备案，认定时间以公示时间为准，核发证书编号，并在高新技术企业认定管理工作网上公告企业名单，由认定机构向企业颁发统一印制的高新技术企业证书（加盖认定机构科技、财政、税务部门公章）；有异议的，须以书面形式实名向领导小组办公室提出，由认定机构核实处理。
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