1、申请。技术合同依法成立后，由合同卖方当事人（技术开发方、转让方、顾问方和服务方）在技术合同成立之日起30日内，凭完整的合同文本和有关附件，向所在地的技术合同登记机构申请登记。
2、受理。技术合同登记机构在对合同形式、签章手续及有关附件、证照进行初步查验，确认符合《民法典》、《技术合同认定登记管理办法》等要求的，予以受理。
3、审查认定。技术合同登记机构审查和认定申请登记的合同是否属于技术合同、属于何种技术合同。
4、办理登记。技术合同登记机构根据规定，对符合技术合同条件的技术合同进行分类，填写技术合同登记表，编列技术合同登记序号，在技术合同文本上填写登记序号，加盖技术合同登记专用章，发给当事人技术合同登记证明。对于非技术合同或不予登记的合同应在合同文本上注明“未予登记”的字样。
5、核定技术性收入。核定的技术交易额要在技术合同中单独载明。技术开发合同或者技术转让合同包含技术咨询、技术服务内容的，技术咨询、技术服务所得的报酬，可以计入技术交易额。
一、为什么要进行技术合同认定登记？
1、经认定登记的技术合同，当事人可以依照有关规定享受国家有关促进科技成果转化的税收信贷和奖励等方面的优惠政策，而未申请认定登记和未予登记的合同不得享受有关优惠政策。优惠政策主要包括：企业支付的技术价款、报酬、使用费或者佣金可以按照国家有关规定摊入成本；对从事技术转让，技术开发业务和与之相关的技术咨询，技术服务取得的收入，免征营业税和所得税等。
2、技术合同登记机构可以通过认定登记帮助当事人完善合同，从而提高合同的履约率，减少技术合同的纠纷。
3、从事技术开发、技术转让、技术服务、技术咨询的企业，可在纯收入中提取20％至30％作为当事人的津贴和奖励，奖励金额均不计入单位奖金总额。另外，技术合同登记数量和金额是科技项目参与评奖的重要参考指标。
4、技术合同登记数量和交易额可作为企业（或个人）的资信凭证之一，可以帮助企业（或个人）更顺利的在银行获得贷款，提高企业（或个人）在银行的信誉度。
5、经认定登记的技术合同交易额是高新技术企业资格年审复核和企业所得税减免的重要考核依据。
6、技术市场的管理部门可以通过技术合同的认定登记，加强对技术市场和科技成果转化工作的宏观指导，管理和服务，并进行相关的技术市场的统计和分析工作。
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