根据《中华人民共和国行政处罚法》第三十六条的规定，行政机关在认定、处理违法建筑之前应该进行调查，比如确切的违法建筑面积、建筑时间、相应证据如照片等。经过行政机关经调查取证，确认建筑物违法后，对违法搭建人作出责令停止违法行为通知书，责令其停止违法建设行为。搭建人拒不拆除违法建筑的，行政机关在作出行政处罚决定前，依法向其发出行政处罚告知书，告知拟处罚结果和被处罚人陈述、申辩等权利。
在作出违法建筑的认定之后，有权的政府机关会作出另外一份限期拆除决定，要求当事人在法定的期限内拆除违法建筑。并依据《中华人民共和国行政处罚法》第三十一条、四十一条的规定，行政机关在会给予公民合理的陈述、申辩的权利。
房屋所有人如果在限拆决定规定的期限内如果没有履行拆除的义务，人民政府会下发强制拆除决定，要求在一定的期限自行拆除违法建筑，若没有自行拆除，那么将有执法权的人民政府依法强拆或者申请法院来进行强制拆除。
一、政府可以强制拆迁吗
现在政府可以强拆，需经过法定程序。对违法的建筑物、构筑物、设施等需要强制拆除的，应当由行政机关予以公告，限期当事人自行拆除。当事人在法定期限内不申请行政复议或者提起行政诉讼，又不拆除的，行政机关可以依法强制拆除。
1、对于违法建筑物、构筑物和设施县级以上地方人民政府责成有关部门或者乡、镇人民政府可以依法组织强拆；
2、对于作出国有土地上房屋征收补偿决定的市、县级人民政府，经人民法院裁定准予组织强拆；
3、依据《行政强制法》的规定，行政机关依法作出行政决定后，当事人在行政机关决定的期限内不履行义务的，具有行政强制执行权的行政机关依照本章规定强制执行；
4、对于违法建筑物、构筑物和设施、在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施、已作出征收补偿决定国有土地上的房屋经过司法诉讼，已产生法律效力的裁判文书，有管辖权的人民法院可以依法组织强拆。
二、厂房违法建筑如何处理
首先，要审查违法建筑认定的合法性，按照现行法律的规定，只能是市县人民政府的规划建设主管部门认定厂房属于违法建筑，否则就涉嫌主体不适格。其次，要审查行政机关在认定、拆除违法建筑之前是否尽了调查义务。根据《中华人民共和国行政处罚法》第36条的规定，行政机关在认定、处理违法建筑之前应该进行调查，比如确切的违法建筑面积、建筑时间、相应证据如照片等，否则就是违法。次之，充分利用公民陈述申辩的权利，《中华人民共和国行政处罚法》第31条、41条的规定，行政机关在处理之前应该给予公民合理的陈述、申辩的权利，否则就剥夺了公民的权利。具体在案件中，就是是否在认定、处理违法建筑前通知公民进行陈述、申辩，是否给予了合理的时间等。最后，如果厂房以违法建筑的名义被拆除，那么针对于强拆的行为，可以通过行政复议或者行政诉讼等途径来进行救济。如果强拆行为不具备前面的合法的认定违法的依据和法定程序来进行拆除的话，那么它的这个强拆的行为可能涉嫌违法，可以通过法律途径来救济。
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