被告提出管辖权异议，法院在收到申请后首先应该审查，然后作出书面裁定：异议成立的，裁定将案件移送有管辖权的人民法院；异议不成立的，裁定驳回，案件继续审理。最后如果当事人对法院的异议裁定不服，可以在收到裁定书之日起10日内上诉。向受理的人民法院申请管辖权异议。法院间有争议的提请共同的上级人民法院解决。
法律依据：《中华人民共和国民事诉讼法》 第一百二十七条规定 管辖权异议和应诉管辖 人民法院受理案件后，当事人对管辖权有异议的，应当在提交答辩状期间提出。人民法院对当事人提出的异议，应当审查。异议成立的，裁定将案件移送有管辖权的人民法院；异议不成立的，裁定驳回。当事人未提出管辖异议，并应诉答辩的，视为受诉人民法院有管辖权，但违反级别管辖和专属管辖规定的除外。
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