1、分居期间的财产归属问题
夫妻分居期间，在法律上婚姻关系仍然存续，如果没有约定，双方的收入仍然是夫妻共同财产，离婚时按照共同财产进行分割。夫妻单方申明分居期间财产归各自所有是无效的，必须得到对方的认可和承认，才能视为个人财产。
2、分居期间的债权债务问题
根据法律规定，夫妻婚姻关系存续期间(包括分居期间)，可以书面约定一方所得的财产归其个人所有，一方的对外债务由借债人自行承担。同时，为了避免夫妻双方为逃避债务恶意作出不利于债权人的约定，法律规定，夫妻间的类似约定，必须明确告知债权人。只有夫妻一方有证据证明，债权人知道夫妻双方关于财产各自所有、债务由各自承担的约定，才能以此对抗对方的债权人。
3、分居期间的子女抚养问题
抚养子女是父母的法定义务。即便夫妻离婚或分居，也不能免除一方对子女的抚养责任(除非子女已经成年，或者父母丧失抚养能力)。因此，分居期间单独承担子女抚养义务的一方，有权要求未承担抚养义务的另一方支付抚养费。
一、分居三年的如何离婚
1、分居三年可以选择协议离婚，也可以选择诉讼离婚。如果双方都愿意离婚，可以先签订离婚协议书，然后共同去婚姻登记机关办理离婚登记手续。如果另一方不愿意离婚，那想要离婚的一方可以去法院起诉。
2、法律依据：《民法典》第一千零七十九条，夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
(一)重婚或者与他人同居；
(二)实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
(三)有赌博、吸毒等恶习屡教不改；
(四)因感情不和分居满二年；
(五)其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
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