个人独资企业停业应当向税务机关提出停业登记，说明停业的理由、时间、停业前的纳税情况和发票的领、用、存情况，并如实填写申请停业登记表。税务机关经过审核(必要时可实地审查)，应当责成申请停业的纳税人结清税款，办理停业登记。
《税务登记管理办法》第二十一条经核准停业在15日以上的纳税人，税务机关应当相应调整已经核定的应纳税额。具体调整的时限或额度由省、自治区、直辖市税务机关确定。
第二十二条纳税人停业期间发生纳税义务，应当及时向主管税务机关申报，依法补缴应纳税款。
第二十三条纳税人应当于恢复生产、经营之前，向税务机关提出复业登记申请，经确认后，办理复业登记，领回或启用税务登记证件和发票领购薄及其领购的发票，纳入正常管理。
纳税人停业期满不能及时恢复生产、经营的，应当在停业期满前向税务机关提出延长停业登记。
一、企业歇业有什么规定要遵守
第二十条业法人歇业、被撤销、宣告破产或者因其他原因终止营业，应当向登记主管机关办理注销登记。
第二十一条业法人办理注销登记，应当提交法定代表人签署的申请注销登记报告、主管部门或者审批机关的批准文件、清理债务完结的证明或者清算组织负责清理债权债务的文件。经登记主管机关核准后，收缴《企业法人营业执照》、《企业法人营业执照》副本，收缴公章，并将注销登记情况告知其开户银行。
第二十二条业法人领取《企业法人营业执照》后，满六个月尚未开展经营活动或者停止经营活动满一年的，视同歇业，登记主管机关应当收缴《企业法人营业执照》、《企业法人营业执照》副本，收缴公章，并将注销登记情况告知其开户银行。
个人独资企业停业必须依照法律的规定，先到当地的税务机关缴纳企业在经营期间所需要缴纳的税额。并且由于企业的停业，不少职员会被停职，故而即使是个人独资类型的企业，若是停业，也需要按照规定，支付给这些职员赔偿金。
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