法律分析：全勤奖属于正常出勤的工资待遇，工伤职工停工留薪期原工资福利待遇不变，不应当受到影响。工资被克扣的处理方式如下：1、与用人单位协商。如果被克扣工资，可以先与用人单位负责人了解情况，询问原因，可以选择与负责人私下和解，协商解决。2、向劳动纠纷调解委员会申请调解。3、向劳动监察大队投诉。4、向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。5、仲裁后不服可向人民法院起诉。
法律依据：《中华人民共和国劳动法》
第四十六条 工资分配应当遵循按劳分配原则，实行同工同酬。
工资水平在经济发展的基础上逐步提高。国家对工资总量实行宏观调控。
第四十七条 用人单位根据本单位的生产经营特点和经济效益，依法自主确定本单位的工资分配方式和工资水平。
第四十八条 国家实行最低工资保障制度。最低工资的具体标准由省、自治区、直辖市人民政府规定，报国务院备案。
用人单位支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。
第五十条 工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
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