闲置土地两年以上的收回流程如下：
1、征缴土地闲置费。
（1）因主观原因造成土地闲置时间满一年未满两年的，由国土资源部门报同级人民政府批准后，按出让或划拨地价款或转让价款的20%征缴土地闲置费，并给予延长《建设用地批准书》有效期限，但延长有效期限最长不超过一年；
（2）因主观原因造成土地闲置时间超过两年的，土地开发项目、资金均已落实，能在一年内进行开发建设的，由用地单位提交发改部门的项目证明文件，银行金融机构出具的资金证明，资金金额达到法定要求，并书面承诺在一年内进行动工开发建设，由国土资源主管部门报同级人民政府批准后，按出让或划拨地价款或转让价款的20%征缴土地闲置费，并给予延长《建设用地批准书》有效期限，但延长有效期限最长不超过一年；
2、延长动工开发建设期限因客观原因暂时未能消除造成土地闲置的，在客观原因消除后给予延长建设期限一年，土地使用权人应出具书面承诺，在延长的期限内动工建设。属于因政府、政府有关部门的行为造成动工开发延迟的客观原因，政府、政府有关部门应负责消除；
3、协议收购土地使用权土地使用权人放弃开发意愿或者不具备继续开发能力的，土地使用权人在接到国土资源主管部门通知25个工作日内向政府土地储备部门申请协议收回土地使用权。政府土地储备机构与土地使用权人签订收购协议前，应由国土资源主管部门先行落实闲置土地处置。协议收购补偿按相关政策法规执行；
4、无偿收回土地使用权。经批准非农业建设占用耕地连续两年未使用的，属于法律规定的无偿收回国有土地使用权的情形之一。经过拟订收回方案、听证、报批、下达决定书、注销登记、补偿的法定程序即可收回土地使用权。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国土地管理法》 第三十八条 禁止任何单位和个人闲置、荒芜耕地。已经办理审批手续的非农业建设占用耕地，一年内不用而又可以耕种并收获的，应当由原耕种该幅耕地的集体或者个人恢复耕种，也可以由用地单位组织耕种；一年以上未动工建设的，应当按照省、自治区、直辖市的规定缴纳闲置费；连续二年未使用的，经原批准机关批准，由县级以上人民政府无偿收回用地单位的土地使用权；该幅土地原为农民集体所有的，应当交由原农村集体经济组织恢复耕种。
在城市规划区范围内，以出让方式取得土地使用权进行房地产开发的闲置土地，依照《中华人民共和国城市房地产管理法》的有关规定办理。
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