海关扣货的处理方式如下：
1、第一时间联系客户：如果货物被目的港海关扣下来，要第一时间联系客户，商讨解决方案，最好让目的港客户协助去清关，避免扩大商业纠纷，影响信誉及后续合作；
2、及时联系报关行：货物被扣后，海关通常会发通知。要仔细看清通知的内容，注意看问题出在哪里然后及时通知报关行；
3、准确回复海关，并提供充足证据：海关在下达通知后会给一定时间来准备要提供的文件材料等。这些都要看清楚，要在通知规定的时间内回复。如果想要自己回复信件给海关也可以，那就要在报关行的配合下，把这些资料通过报关行发给海关；
4、执行海关的处理决定：
（1）因申报货值太低扣关，补交关税后从海关拿货出来；
（2）手续不全的货物扣关，比如个人进口，海关要求有进口权，找有进扣权的公司代理清关；
（3）如果是需要相关认证手续的，尽早补办尽早提供，但提供不了的话就无法清关；
（4）可以向海关申请货物退运，按国际惯例，清关不了的货物可以申请退运回发货地或是第三方贸易港口。
法律依据：《中华人民共和国海关法》第六条
海关可以行使下列权力：
（一）检查进出境运输工具，查验进出境货物、物品；对违反本法或者其他有关法律、行政法规的，可以扣留；
（二）查阅进出境人员的证件；查问违反本法或者其他有关法律、行政法规的嫌疑人，调查其违法行为；
（三）查阅、复制与进出境运输工具、货物、物品有关的合同、发票、帐册、单据、记录、文件、业务函电、录音录像制品和其他资料；对其中与违反本法或者其他有关法律、行政法规的进出境运输工具、货物、物品有牵连的，可以扣留；
（四）在海关监管区和海关附近沿海沿边规定地区，检查有走私嫌疑的运输工具和有藏匿走私货物、物品嫌疑的场所，检查走私嫌疑人的身体；对有走私嫌疑的运输工具、货物、物品和走私犯罪嫌疑人，经直属海关关长或者其授权的隶属海关关长批准，可以扣留；对走私犯罪嫌疑人，扣留时间不超过二十四小时，在特殊情况下可以延长至四十八小时；
在海关监管区和海关附近沿海沿边规定地区以外，海关在调查走私案件时，对有走私嫌疑的运输工具和除公民住处以外的有藏匿走私货物、物品嫌疑的场所，经直属海关关长或者其授权的隶属海关关长批准，可以进行检查，有关当事人应当到场；当事人未到场的，在有见证人在场的情况下，可以径行检查；对其中有证据证明有走私嫌疑的运输工具、货物、物品，可以扣留。
海关附近沿海沿边规定地区的范围，由海关总署和国务院公安部门会同有关省级人民政府确定；
（五）在调查走私案件时，经直属海关关长或者其授权的隶属海关关长批准，可以查询案件涉嫌单位和涉嫌人员在金融机构、邮政企业的存款、汇款；
（六）进出境运输工具或者个人违抗海关监管逃逸的，海关可以连续追至海关监管区和海关附近沿海沿边规定地区以外，将其带回处理；
（七）海关为履行职责，可以配备武器。海关工作人员佩带和使用武器的规则，由海关总署会同国务院公安部门制定，报国务院批准；
（八）法律、行政法规规定由海关行使的其他权力。