个人独资企业债务应该按照以下顺序进行清偿：
第一、企业职工工资和社会保险费用。出于对劳动者权益的保障以及社会的安定，企业债务清偿首先应该保障职工的权益。
第二、企业所欠税款。需要向有关部门清偿企业存续期间内，所拖欠的税款。
第三、企业的其他债务。对于企业财产不足以清偿的债务，投资人应当以其个人的其他财产对企业债务进行清偿。
法律依据：
根据《企业破产法》第113条：破产财产不足以清偿同一顺序的清偿要求的，按照比例分配。破产企业的董事、监事和高级管理人员的工资按照该企业职工的平均工资计算。
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