单位缴纳医保本人不用交新农合。
城镇职工基本医疗保险和新型农村合作医疗属于同一性质的社会医疗保险，参保人不需要参加同样性质的医疗保险。即使参加两种保险，住院报销时也只能报销一种。
城镇医疗和农村合作医疗的区别具体如下：
1、参保人不同。城镇医疗（即职工医保）是由职工参保，保费由用人单位和职工共同缴纳，而农村合作医疗由政府组织、引导、支持，农民自愿参加，个人、集体和政府多方筹资，以大病统筹为主的农民医疗互助共济制度；
2、城镇医疗所需要缴纳的保费和报销的费用相对于农村合作医疗来较高；
3、农村合作医疗的起付线相对于城镇医疗较低。
新型农村合作医疗报销范围为参加人员在统筹期内因病在定点医院住院诊治所产生的药费、检查费、化验费、手术费、治疗费、护理费等符合城镇职工医疗保险报销范围的部分（即有效医药费用）。
新型农村合作医疗基金支付设立起付标准和最高支付限额。医院年起付标准以下的住院费用由个人自付。同一统筹期内达到起付标准的，住院两次及两次以上所产生的住院费用可累计报销。超过起付标准的住院费用实行分段计算，累加报销，每人每年累计报销有最高限额。
法律依据
《中华人民共和国社会保险法》
第二十三条 职工应当参加职工基本医疗保险，由用人单位和职工按照国家规定共同缴纳基本医疗保险费。
无雇工的个体工商户、未在用人单位参加职工基本医疗保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员可以参加职工基本医疗保险，由个人按照国家规定缴纳基本医疗保险费。第二十四条 国家建立和完善新型农村合作医疗制度。
新型农村合作医疗的管理办法，由国务院规定。
