合作医疗项目的报销方式包括门诊报销、住院报销、大病补助、意外伤害、异地医疗等。参保人需根据具体情况在指定医疗单位刷卡或办理手续，提交相关资料后费用将直接打入医保卡。特殊情况如第三方出资、特定医疗项目等不在农村医疗保险范围内。根据《中华人民共和国社会保险法全文》，职工应参加基本医疗保险，缴费由用人单位和职工共同承担，个体工商户和其他灵活就业人员需个人缴费。

法律分析

不同的合作医疗项目有不同的报销方式，具体如下：

1、门诊报销：开通农村医疗保险卡后，直接在指定医疗单位收费处刷卡，报销比例，所报销的费用直接在收费单上显示。

2、住院报销：直接出具农村医保卡，交上押金并办理入院手续，在参保人员出院时，报销费用直接产生后扣除，结帐出院。

3、大病补助：在住院时产生的高费用，可以申请大病补助，提出申请，到民办处拿表填写资料，开出证明后，带身份证，户口本，农村医保卡等复印件到民办处，审核后直接打入参保人医保卡。

4、意外伤害：意外流产住院，在有准生证的出院后，可以在农村医疗保险指定的医疗单位用医疗保险卡直接刷卡，还没有办理的需及时补办准生证，去镇上医疗合作社提交医院单位的病历证明，收据，并提交医疗保险卡复印件，工作人员审核后15个工作日会打入参保人员的医保卡里。

5、异地医疗：异地工作人员也能享受直接刷卡，如果异地就诊需本地医疗单位开具转诊证明，异地出院后须提交转诊证明，病历证明，出院收费单，身份证，户口本，农村医疗保险卡等有效证明到本地医疗合作社办理。

6、特殊情况：参保人不在农村医疗保险指定的医疗单位，或有第三方出资，儿童疫苗，美容，牙齿矫正，人流，醉酒，打架斗殴等都不在农村医疗保险范围之内。

法律客观：

《中华人民共和国社会保险法全文》第二十三条职工应当参加职工基本医疗保险，由用人单位和职工按照国家规定共同缴纳基本医疗保险费。无雇工的个体工商户、未在用人单位参加职工基本医疗保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员可以参加职工基本医疗保险，由个人按照国家规定缴纳基本医疗保险费。

结语

通过农村医疗保险卡，不同的合作医疗项目实行不同的报销方式。门诊报销直接刷卡，住院报销在出院时结算，大病补助需申请并审核后打入医保卡，意外伤害需提供相关证明并审核后打入医保卡，异地医疗需办理转诊手续并提交相关证明办理报销。特殊情况如疫苗、美容、牙齿矫正等不在保险范围内。根据《中华人民共和国社会保险法全文》，职工应参加基本医疗保险，缴费由用人单位和职工共同承担，个体工商户等其他灵活就业人员可自行缴费参保。

法律依据

医疗事故处理条例：第五章 医疗事故的赔偿 第五十一条 参加医疗事故处理的患者近亲属所需交通费、误工费、住宿费，参照本条例第五十条的有关规定计算，计算费用的人数不超过2人。

医疗事故造成患者死亡的，参加丧葬活动的患者的配偶和直系亲属所需交通费、误工费、住宿费，参照本条例第五十条的有关规定计算，计算费用的人数不超过2人。

司法鉴定程序通则：第一章 总 则 第十条 司法鉴定机构应当加强对司法鉴定人执业活动的管理和监督。司法鉴定人违反本通则规定的，司法鉴定机构应当予以纠正。

司法鉴定程序通则：第四章 司法鉴定意见书的出具 第三十六条 司法鉴定机构和司法鉴定人应当按照统一规定的文本格式制作司法鉴定意见书。