1、两种行为当事人不同。国有土地使用权出让行为的当事人，一方是作为土地所有者代表的市、县人民政府土地管理部门等，另一方是土地使用者。土地使用权转让行为的当事人双方都是土地使用者。
2、两种行为的标的不同。国有土地使用权出让行为的标的有两个特征，一是出让土地使用权的地块面积大，二是土地使用权让渡期限长，而土地使用权转让者所涉及地块的面积和让渡期限一般低于前者。
3、两种行为运行机制上不同。土地使用权出让的运行机制体现为垄断竞争性。其垄断性表现为国家是土地使用权的唯一的提供者；其竞争性表现在土地使用权的需求方多样性，以及土地使用权出让方式的灵活性。
4、两种行为当事人权利与义务的不同。从现行法律规定来看，土地使用权出让时，土地使用者应当在签订土地使用权出让合同后六十日内，支付全部土地使用权出让金。
【本文关联的相关法律依据】
《农村土地承包经营权流转管理办法全文》第三十五条
本办法所称转让是指承包方有稳定的非农职业或者有稳定的收入来源，经承包方申请和发包方同意，将部分或全部土地承包经营权让渡给其他从事农业生产经营的农户，由其履行相应土地承包合同的权利和义务。转让后原土地承包关系自行终止，原承包方承包期内的土地承包经营权部分或全部灭失。转包是指承包方将部分或全部土地承包经营权以一定期限转给同一集体经济组织的其他农户从事农业生产经营。转包后原土地承包关系不变，原承包方继续履行原土地承包合同规定的权利和义务。接包方按转包时约定的条件对转包方负责。承包方将土地交他人代耕不足一年的除外。互换是指承包方之间为方便耕作或者各自需要，对属于同一集体经济组织的承包地块进行交换,同时交换相应的土地承包经营权。入股是指实行家庭承包方式的承包方之间为发展农业经济，将土地承包经营权作为股权，自愿联合从事农业合作生产经营;其他承包方式的承包方将土地承包经营权量化为股权，入股组成股份公司或者合作社等，从事农业生产经营。出租是指承包方将部分或全部土地承包经营权以一定期限租赁给他人从事农业生产经营。出租后原土地承包关系不变，原承包方继续履行原土地承包合同规定的权利和义务。承租方按出租时约定的条件对承包方负责。本办法所称受让方包括接包方、承租方等。
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