农村合作医疗保险的报销，可以参照下列流程进行报销即可。具体如下：
1、新农合参保患者可以凭本人身份证、医保卡，在区内乡镇级普通门诊定点医疗机构可直接刷卡报销，在区内及区外市内定点医疗机构住院，出院结帐时直接刷卡报销。
2、在市外二级及二级以上的公立医疗机构医院住院治疗的参保患者，应在出院后的3个月后，将擦那波人的医药费原始发票、住院医药费用汇总明细清单、出院小结、医疗卡、户口本、门诊病历、经办人身份证直接到新农合窗口报销医药费用。
3、特殊病种门诊报销，参保患者可持二级及二级以上定点医疗机构出具的病历及相关检查报告资料以及《新农合特殊病种门诊治疗审批表》想新农合业管中心提出申请，经过审核批准之后，其门诊医药费用是可以列入到新农合的报销范围内的。
4、因意外伤害住院的话只能和，出院后需要提交意外伤害引发的原因证明和医院的病案记录，对于一些无法提供有效证明和记录的，不予进行受理。参保患者将资料调教之后，新农合窗口受理后的30个工作日内完成，不过，需要经过新农合业管中心稽查人员的调查和审核，情况属实之后才能予以报销。《社会保险法》第二条国家建立基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险等社会保险制度，保障公民在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利。
法律依据
第六十四条 社会保险基金包括基本养老保险基金、基本医疗保险基金、工伤保险基金、失业保险基金和生育保险基金。除基本医疗保险基金与生育保险基金合并建账及核算外，其他各项社会保险基金按照社会保险险种分别建账，分账核算。社会保险基金执行国家统一的会计制度。
社会保险基金专款专用，任何组织和个人不得侵占或者挪用。
基本养老保险基金逐步实行全国统筹,其他社会保险基金逐步实行省级统筹，具体时间、步骤由国务院规定。
第六十五条 社会保险基金通过预算实现收支平衡。
县级以上人民政府在社会保险基金出现支付不足时，给予补贴。
第六十六条 社会保险基金按照统筹层次设立预算。除基本医疗保险基金与生育保险基金预算合并编制外，其他社会保险基金预算按照社会保险项目分别编制。
