二手房交易缴纳契税，由不动产登记机关向税务机关提供契税缴纳资料，由纳税人向房屋所在地的税务机关缴纳。契税的纳税人是买受房屋权属的单位或个人，即房屋买卖关系中的买方。二手房交易中契税缴纳税率分为：家庭唯一住房且90平米以下的1%，90平米以上的1.5%；二套房90平米以下的1%，90平米以上的2%。以上标准为住宅类住房的契税缴纳税率，如果是非住宅类的房屋，则一般按3%税率交纳契税。契税具体缴纳的金额是房屋成交价格或评估价格乘以税率。上述二套房指的是家庭已有一套住房的情况下购买第二套改善型住房，而不是家庭第二次购房。如果家庭第二次购房时已经将第一套房出售，仍按首套房计税。以上税率规定不适用于北上广深地区。
《中华人民共和国契税暂行条例》第三条契税税率为3－5％。契税的适用税率，由省、自治区、直辖市人民政府在前款规定的幅度内按照本地区的实际情况确定，并报财政部和国家税务总局备案。《中华人民共和国契税暂行条例》第六条有下列情形之一的，减征或者免征契税：（一）国家机关、事业单位、社会团体、军事单位承受土地、房屋用于办公、教学、医疗、科研和军事设施的，免征；（二）城镇职工按规定第一次购买公有住房的，免征；（三）因不可抗力灭失住房而重新购买住房的，酌情准予减征或者免征；（四）财政部规定的其他减征、免征契税的项目。财政部、国家税务总局、住房城乡建设部《关于调整房地产交易环节契税营业税优惠政策的通知》财税〔2016〕23号文一、关于契税政策（一）对个人购买家庭唯一住房（家庭成员范围包括购房人、配偶以及未成年子女，下同），面积为90平方米及以下的，减按1%的税率征收契税；面积为90平方米以上的，减按1.5%的税率征收契税。（二）对个人购买家庭第二套改善性住房，面积为90平方米及以下的，减按1%的税率征收契税；面积为90平方米以上的，减按2%的税率征收契税。家庭第二套改善性住房是指已拥有一套住房的家庭，购买的家庭第二套住房。三、关于实施范围北京市、上海市、广州市、深圳市暂不实施本通知第一条第二项契税优惠政策及第二条营业税优惠政策，上述城市个人住房转让营业税政策仍按照《财政部国家税务总局关于调整个人住房转让营业税政策的通知》（财税〔2015〕39号）执行。
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