首先，土地证面积小于房产证，甚至有较大差距，这种情况是正常的。
1、房产证上的面积是房屋的建筑面积，包含房屋建筑分摊面积和实用面积；
2、土地证上的面积是土地的分摊面积，一般来说，楼层越高，户数越多，土地证上的面积也就越小。
3、如果是多层甚至高层，土地面积可能大大小于房产证上的建筑面积；
4、不过如果是独栋别墅，土地面积也许还会多于房产证的建筑面积。
5、对于商品房来说，土地面积只是体现了土地的产权，并没有实际面积。土地证上的面积大小无影响，只是在缴纳土地出让金时候有点影响。
6、关于土地面积的分摊方式有多种，但一般采取的方式是：按照建筑物面积进行分摊。某部分分摊的土地面积=土地总面积*（该部分的建筑物面积/建筑物总面积）
因此，房产证和土地证一个是“房屋”，一个算“土地”，面积自然各不相同。
【本文关联的相关法律依据】
《商品房销售管理办法》：
第十八条商品房销售可以按套（单元）计价，也可以按套内建筑面积或者建筑面积计价。
商品房建筑面积由套内建筑面积和分摊的共有建筑面积组成，套内建筑面积部分为独立产权，分摊的共有建筑面积部分为共有产权，买受人按照法律、法规的规定对其享有权利，承担责任。
按套（单元）计价或者按套内建筑面积计价的，商品房买卖合同中应当注明建筑面积和分摊的共有建筑面积。
《商品房销售管理办法》：
第二十一条按建筑面积计价的，当事人应当在合同中约定套内建筑面积和分摊的共有建筑面积，并约定建筑面积不变而套内建筑面积发生误差以及建筑面积与套内建筑面积均发生误差时的处理方式。
《商品房销售管理办法》：
第二十条按套内建筑面积或者建筑面积计价的，当事人应当在合同中载明合同约定面积与产权登记面积发生误差的处理方式。
合同未作约定的，接以下原则处理：
（一）面积误差比绝对值在3%以内（含3%）的，据实结算房价款；
（二）面积误差比绝对值超出3%时，买受人有权退房。买受人退房的，房地产开发企业应当在买受人提出退房之日起30日内将买受人已付房价款退还给买受人，同时支付已付房价款利息。买受人不退房的，产权登记面积大于合同约定面积时，面积误差比在3%以内（含3%）部分的房价款由买受人补足；超出3%部分的房价款由房地产开发企业承担，产权归买受人。产权登记面积小于合同约定面积时，面积误差比绝对值在3%以内（含3%）部分的房价款由房地产开发企业返还买受人；绝对值超出3%部分的房价款由房地产开发企业双倍返还买受人。
面积误差比＝（产权登记面积-合同约定面积）/合同约定面积×100%
因本办法第二十四条规定的规划设计变更造成面积差异，当事人不解除合同的，应当签署补充协议。
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