中标质疑函回复时限为三天，自收到异议之日起计算。
根据我国《中华人民共和国招标投标法实施条例》规定，依法必须进行招标的项目，招标人应当自收到评标报告之日起3日内公示中标候选人，公示期不得少于3日。
投标人或者其他利害关系人，对依法必须进行招标的项目的评标结果有异议的，应当在中标候选人公示期间提出。招标人应当自收到异议之日起3日内作出答复；作出答复前，应当暂停招标投标活动。
中标后甲方还能质疑吗
肯定有用。一般是招标人需要写报告给上级监管部门（即招标文件备案部门）申请进行重评、重招、或者取消中标人资格由第二名顶上，取得上级意见后，在进行下一步（根据上级批复或指示，进行重评、重招、或者取消中标人资格由第二名顶上）公开招标的都需要公示。
1、政府采购项目流程操作规范性是有保障的，所以质疑只能是在公示期间提出。可能是公共资源交易中心与你沟通时疏忽，不知道有质疑。
2、质疑供应商不可能看到你的投标文件，但其对其他供应商的情况有一定了解。所以可以根据自己的理解提出质疑。
3、甲方或评标专家泄露评标信息的情况很少见，如被发现处罚很严重。
4、公共资源交易中心收到质疑后，应当组织专家对评审过程和资料进行复核、并答复质疑人。
相关法律规定
《招标投标法》
第四十五条之规定：“中标通知书对招标人和中标人具有法律效力。中标通知发出后，招标人改变中标结果的，或者中标人放弃中标项目的，应当依法承担法律责任(也即民事赔偿责任)。”
又依据七部委30号令《工程建设项目施工招标投标办法》第八十一条之规定：“中标通知发出后，中标人放弃中标项目的，无正当理由不与招标人签订合同的，在签订合同时向招标人提出附加条件或者更改合同实质性内容的，或者拒不提交所要求的履约保证金的，招标人可取消其中标资格，并没收其投标保证金;给招标人的损失超过投标保证金数额，中标人应当对超过部分予以赔偿;没有提交投标保证金的，应当对招标人的损失承担赔偿责任。”
中标质疑期限一般多少天
中标质疑期限要根据法律规定。
工程建设潜在投标人或者其他利害关系人对资格预审文件有异议的，应当在提交资格预审申请文件截止时间2日前提出；对招标文件有异议的，应当在投标截止时间10日前提出。招标人应当自收到异议之日起3日内作出答复；作出答复前，应当暂停招标投标活动。 投标人或者其他利害关系人对依法必须进行招标的项目的评标结果有异议的，应当在中标候选人公示期间提出。招标人应当自收到异议之日起3日内作出答复；作出答复前，应当暂停招标投标活动。
法律依据：
《中华人民共和国招标投标法实施条例》五十四条 依法必须进行招标的项目，招标人应当自收到评标报告之日起3日内公示中标候选人，公示期不得少于3日。
投标人或者其他利害关系人对依法必须进行招标的 该内容由 周琦律师 和 律说律答 共创回答
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