公司的注册资金是要用来偿还债务的。股东出资没有到位，在 公司破产清算 时需要补缴。注册资金是公司 股东承担责任 的依据，在有限责任股份公司里，股东是依据股东的出资额进行担责的。在公司倒闭后，公司的注册资金是要用来偿还债务的。
《企业破产法》第二条
企业法人不能清偿到期债务，并且资产不足以清偿全部债务或者明显缺乏清偿能力的，依照本法规定清理债务。
企业法人有前款规定情形，或者有明显丧失清偿能力可能的，可以依照本法规定进行重整。
《公司法》第一百八十七条
清算组在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单后，发现公司财产不足清偿债务的，应当依法向人民法院申请宣告破产。
公司经人民法院裁定宣告破产后，清算组应当将清算事务移交给人民法院。
