可以报销。
新型农村合作医疗报销范围为：参加人员在统筹期内因病在定点医院住院诊治所产生的药费、检查费、化验费、手术费、治疗费、护理费等符合城镇职工医疗保险报销范围的部分(即有效医药费用)。
新型农村合作医疗基金支付设立起付标准和最高支付限额。医院年起付标准以下的住院费用由个人自付。同一统筹期内达到起付标准的，住院两次及两次以上所产生的住院费用可累计报销。超过起付标准的住院费用实行分段计算，累加报销，每人每年累计报销有最高限额。
二、报销所需资料
1.门诊报销携带资料：门诊发票、合作医疗证历本(或病历)。
2.住院报销携带资料：住院发票、合作医疗证历本(或病历)、费用明细清单、出院小结、其它有关证明。
3.门诊特殊病报销携带资料：门诊发票、特殊病种合作医疗证历本。
4.办理特殊病种携带资料：特殊病种门诊治疗建议书，合作医疗证历本、病历、有关化验报告单、照片二张。
根据以上内容的相关回答可以得出，在做人流手术的时候，可以用农村合作医疗保险报销的，在报销的过程中涉及到的门诊费用，化验费用，手术费用，治疗费用都是按照一定比例报销。
法律依据：
《中华人民共和国社会保险法》第二十六条
职工基本医疗保险、新型农村合作医疗和城镇居民基本医疗保险的待遇标准按照国家规定执行。
第二十八条
符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付
