公司申请破产后，员工尚未领取全部工资，员工可以采取以下措施：
1、提交工资申请。员工可以向公司提交工资申请，要求公司支付尚未发放的工资和加班费等。在提交申请时，员工应提供相关证据，如工资条、劳动合同等，以便公司审核；
2、向破产管理人提出申请。如果公司已经进入破产程序，员工可以向破产管理人提出工资申请。破产管理人有权对员工的工资申请进行审核，根据破产法规定的优先顺序依次分配破产财产；
3、向劳动监察部门投诉。如果公司拒绝支付工资或者无力支付工资，员工可以向当地劳动监察部门投诉。劳动监察部门会对投诉进行调查，并要求公司支付工资；
4、向法院申请劳动仲裁。如果员工与公司之间存在劳动纠纷，员工可以向法院申请劳动仲裁。劳动仲裁是解决劳动争议的一种有效方式，可以保障员工的合法权益。
公司申请破产后员工需要准备的工资处理材料如下：
1、劳动合同或劳动关系证明。员工应准备自己的劳动合同或者劳动关系证明，证明与公司存在劳动关系，以便证明自己有权获得工资和其他劳动报酬；
2、工资单和银行流水。员工应准备自己的工资单和银行流水，以证明公司尚未支付的工资和其他劳动报酬的具体数额；
3、破产管理人授权书。如果公司已经进入破产程序，员工需要准备破产管理人授权书，以证明自己是受破产管理人委托的债权人之一；
4、破产财产清单。员工需要了解公司的破产财产清单，以便知道是否有足够的财产来清偿员工的工资和其他劳动报酬。如果破产财产不足以清偿员工的工资和其他劳动报酬，员工可能无法获得全部的工资和其他劳动报酬；
5、相关证明材料。员工还需要准备其他相关证明材料，如劳动仲裁裁决书、法院判决书等，以证明自己的权益。
综上所述，如果公司申请破产后员工尚未领取全部工资，员工应及时采取措施维护自己的合法权益。具体措施包括提交工资申请、向破产管理人提出申请、向劳动监察部门投诉或向法院申请劳动仲裁等。
【法律依据】：
《中华人民共和国企业破产法》第一百一十三条
破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，依照下列顺序清偿：
（一）破产人所欠职工的工资和医疗、伤残补助、抚恤费用，所欠的应当划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用，以及法律、行政法规规定应当支付给职工的补偿金；
（二）破产人欠缴的除前项规定以外的社会保险费用和破产人所欠税款；
（三）普通破产债权。
破产财产不足以清偿同一顺序的清偿要求的，按照比例分配。
破产企业的董事、监事和高级管理人员的工资按照该企业职工的平均工资计算。
