法律分析：如果员工个人交社保的，社保里面属于个人应该负担的部分，个人取得的收入，在个人所得税汇算清缴时，填入对应的项目即可在税前进行扣除。如果平时月度申报时，有扣除的，在汇算时，需要确认总的扣缴金额。个人缴纳社保费（包括基本养老保险、基本医疗保险等）是可以税前扣除的。因为灵活就业人员也是按照国家规定的范围和标准缴纳的，而且全部是由个人承担的，所以可以税前扣除，且不需要区分个人部分和单位部分，实际缴纳金额全部都可以税前扣除。个人所得税是调整征税机关与自然人即居民、非居民人之间在个人所得税的征纳与管理过程中所发生的社会关系的法律规范的总称。
个人所得税的纳税义务人，既包括居民纳税义务人，也包括非居民纳税义务人。居民纳税义务人负有完全纳税的义务，必须就其来源于中国境内、境外的全部所得缴纳个人所得税；而非居民纳税义务人仅就其来源于中国境内的所得，缴纳个人所得税。
法律依据：《中华人民共和国个人所得税法》 第一条 在中国境内有住所，或者无住所而一个纳税年度内在中国境内居住累计满一百八十三天的个人，为居民个人。居民个人从中国境内和境外取得的所得，依照本法规定缴纳个人所得税。在中国境内无住所又不居住，或者无住所而一个纳税年度内在中国境内居住累计不满一百八十三天的个人，为非居民个人。非居民个人从中国境内取得的所得，依照本法规定缴纳个人所得税。纳税年度，自公历一月一日起至十二月三十一日止。
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