第一步：计算增值额：房地产转让收入－扣除项目金额；
第二步：计算增值率（目的是与适用税率作比较）：增值额÷扣除项目金额×100％；
第三步：根据土地增值税率表（主要依据上图级距部分），选择适用税率和速算扣除系数；
最后一步，就可以计算应纳税额＝增值额×适用税率－扣除项目金额×速算扣除系数。
一、预征土地增值税计税依据是什么
1、全国普通住宅、非普通住宅、其他类型房产的预征率分别为：2％、3％、4％，其他地区普通住宅、非普通住宅、其他类型房产的预征率按国家税务总局规定的标准，即2％执行。
2、纳税人根据自行计算的预计增加率预缴土地增加税，对计算出的预计增加率大于100％且小于或等于2200％的房地产开发项目，普通住宅、非普通住宅、其他类型房产的预征率均为5％。
3、对计算出的预计增加率大于200％的房地产开发项目，普通住宅、非普通住宅、其他类型房产的预征率均为8％。预计增加率根据《中华人民共和国土地增加税暂行条例》及其实施细则的规定计算。
4、全国保障房仍暂不预征。公共租赁住房、廉租住房、经济适用房、城市和国有工矿棚区改造安置住房等保障性住房，暂不实行预征。
5、目前主要针对不动产和建筑行业采用预征办法，主要有5％、3％和2％的档次。预征增加税是一种出于税款均衡入库需要的预交方法，需要在规定时间内按照规定税率或者征收率重新进行计算和申报。
二、土地增值税如何征收
土地增值税是以转让房地产取得的收入，减除法定扣除项目金额后的增值额作为计税依据，并按照四级超率累进税率进行征收。
（1）增值额未超过扣除项目金额50％部分，税率为30％；
（2）增值额超过扣除项目金额50％，未超过扣除项目金额100％的部分，税率为40％；
（3）增值额超过扣除项目金额100％，未超过扣除项目金额200％的部分，税率为50％；
（4）增值额超过扣除项目金额200％的部分，税率为60％。
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