分配系数理论认为,在色谱柱中,样品成分在流动相(移动相)和固定相(静止相)之间发生分配。样品成分会在两相之间分配不同程度,根据它们在两相之间的分配系数来决定它们在色谱柱中的迁移速度和保留时间。
保留时间理论指出,样品成分在色谱柱中的停留时间与其在固定相上的吸附/解吸过程有关。根据样品成分与固定相之间的相互作用,不同成分将以不同的速度通过色谱柱。保留时间取决于样品分子与固定相的亲疏性,以及流动相的性质。