生物信息学中分析lncRNA的工具有哪些

发布网友 发布时间：2022-04-29 16:19

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热心网友 时间：2023-10-19 00:51

分析lncRNA的工具和方法
1、宏观分析工具
长链非编码RNA研究领域的进展离不开基因组测序和基因芯片技术的广泛使用，如通过构建cDNA文库和测序发现ncRNA；通过比较基因组生物信息分析发现ncRNA；利用tiling芯片、ncRNA芯片检测ncRNA。通过转录组测序或tiling芯片检测，可以在全基因组范围内系统地研究可转录RNA区域，有助于大量发现非编码RNA。基因芯片可以高密度检测所有非编码RNA，通过表达谱研究发现组织特异性、疾病相关性，就可以缩小研究范围，找出值得深入研究的ncRNA目标，再结合传统的基因敲除、RNAi等技术确定其功能和作用机制。
2、微观分析工具
KD方法
A、RNAi方法
化学合成的siRNA
艾博思生物引进国际上比较公认成熟的方法设计5对siRNA oligos，针对客户提供的非编码长链RNA进行干扰
shRNA载体构建
艾博思生物引进国际上比较公认成熟的方法设计5对shRNA vector，针对客户提供的非编码长链RNA进行干扰
B、反义核酸或者核酶技术
利用经典的ASO和Riozyme的方法进行抑制lncRNA的作用，艾博思可以提供DNA或者RNA的合成服务
C、小分子抑制剂的虚拟筛选
艾博思生物信息学团队，通过分子模拟ncRNA的结构，设计小分子抑制剂来干预ncRNA作用
OVER-Expression方法
艾博思生物可以给您全基因合成或者调取已经发现的所有的非编码长链RNA
艾博思生物可以帮你构建表达载体供您使用
选用载体： pcDNA3.1 等等

热心网友 时间：2023-10-19 00:51

分析lncRNA的工具和方法
1、宏观分析工具
长链非编码RNA研究领域的进展离不开基因组测序和基因芯片技术的广泛使用，如通过构建cDNA文库和测序发现ncRNA；通过比较基因组生物信息分析发现ncRNA；利用tiling芯片、ncRNA芯片检测ncRNA。通过转录组测序或tiling芯片检测，可以在全基因组范围内系统地研究可转录RNA区域，有助于大量发现非编码RNA。基因芯片可以高密度检测所有非编码RNA，通过表达谱研究发现组织特异性、疾病相关性，就可以缩小研究范围，找出值得深入研究的ncRNA目标，再结合传统的基因敲除、RNAi等技术确定其功能和作用机制。
2、微观分析工具
KD方法
A、RNAi方法
化学合成的siRNA
艾博思生物引进国际上比较公认成熟的方法设计5对siRNA oligos，针对客户提供的非编码长链RNA进行干扰
shRNA载体构建
艾博思生物引进国际上比较公认成熟的方法设计5对shRNA vector，针对客户提供的非编码长链RNA进行干扰
B、反义核酸或者核酶技术
利用经典的ASO和Riozyme的方法进行抑制lncRNA的作用，艾博思可以提供DNA或者RNA的合成服务
C、小分子抑制剂的虚拟筛选
艾博思生物信息学团队，通过分子模拟ncRNA的结构，设计小分子抑制剂来干预ncRNA作用
OVER-Expression方法
艾博思生物可以给您全基因合成或者调取已经发现的所有的非编码长链RNA
艾博思生物可以帮你构建表达载体供您使用
选用载体： pcDNA3.1 等等

热心网友 时间：2023-10-19 00:51

分析lncRNA的工具和方法
1、宏观分析工具
长链非编码RNA研究领域的进展离不开基因组测序和基因芯片技术的广泛使用，如通过构建cDNA文库和测序发现ncRNA；通过比较基因组生物信息分析发现ncRNA；利用tiling芯片、ncRNA芯片检测ncRNA。通过转录组测序或tiling芯片检测，可以在全基因组范围内系统地研究可转录RNA区域，有助于大量发现非编码RNA。基因芯片可以高密度检测所有非编码RNA，通过表达谱研究发现组织特异性、疾病相关性，就可以缩小研究范围，找出值得深入研究的ncRNA目标，再结合传统的基因敲除、RNAi等技术确定其功能和作用机制。
2、微观分析工具
KD方法
A、RNAi方法
化学合成的siRNA
艾博思生物引进国际上比较公认成熟的方法设计5对siRNA oligos，针对客户提供的非编码长链RNA进行干扰
shRNA载体构建
艾博思生物引进国际上比较公认成熟的方法设计5对shRNA vector，针对客户提供的非编码长链RNA进行干扰
B、反义核酸或者核酶技术
利用经典的ASO和Riozyme的方法进行抑制lncRNA的作用，艾博思可以提供DNA或者RNA的合成服务
C、小分子抑制剂的虚拟筛选
艾博思生物信息学团队，通过分子模拟ncRNA的结构，设计小分子抑制剂来干预ncRNA作用
OVER-Expression方法
艾博思生物可以给您全基因合成或者调取已经发现的所有的非编码长链RNA
艾博思生物可以帮你构建表达载体供您使用
选用载体： pcDNA3.1 等等