如何查找基因的启动子及预测转录因子
发布网友
发布时间:2022-04-27 03:32
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热心网友
时间:2022-06-25 13:11
1.对于已知启动子的生物,就不过多赘述了,网上资源很多,可以上blast等生物信息学网站搜索基因序列,很容易得到序列的
2.对于原核生物来说,启动子一般就在起始密码子上游不远处,是紧密相连的,所以启动子及其*序列一般位于基因上游不远处。
3.对于真核生物来说,启动子有可能在距相应基因的上游或下游,部分甚至距离基因几千kb, 很难准确判断出位置,所以预测的话得用Gel Shift Assay 或者 Dnase I Footprinting 技术来确定,这两个都是比较费时间的实验