大学生物,普通遗传学。QTL
发布网友
发布时间:2022-10-12 23:23
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热心网友
时间:2023-10-12 08:46
大家都是大雪参,你要是想定义之类的话,你的书本肯定有,Wikipedia也有,
我正好毕设是这个,最近看了些文献,所以说下自己的理解,
QTL,quantitative trait loci,既是数量性状,又是位点,位点的意思就是你不能确定它是不是一个gene!QTL是实验与数据分析的结合!
举个玉米株高例子,从头说起,
1、你拿两棵株高差很多的亲缘很远的玉米品种A、B杂交,获得杂合的F1,F1自交获得F2,F2代是分离世代,你发现各株玉米株高差很多,你要把这些株高的数据都统计了。
2、接下来你把它们的DNA都提了,接着,你要设计引物,要PCR。
引物不是一对,而是很多对,要覆盖玉米的全部基因组,每对引物PCR一小段片段,这个片段就是marker!!而书上所说的MM,mm,Mm不是说marker的显隐性,只是表明M来自A品种,m来自B品种。F2代每株的DNA被每个引物PCR一遍,跑胶,知道了每株DNA在每个marker是M还是m。你把这些数据都统计了,算告一段落。
3、接下来,就是你把株高和marker的数据交给软件,因为株高是由QTL的效应引起的,而QTL又是和位置相近的marker相关联,所以软件会帮你分析出,哪两个marker之间存在一个QTL,具体工作原理就是书上的区间分析和复合区间分析,其中有很深的统计学知识。
4、到这里,QTL诞生了,所以,QTL只是两个marker之间的DN*段,或是与一个marker相连的DN*段(单标记分析),中间省略很多实验步骤。
自我理解,平易近人。打字很累,不喜勿喷,喜欢的就采纳吧。
如有不懂可继续追问。。。共同学习进步!
热心网友
时间:2023-10-12 08:46
中文可以翻译成数量性状座位或者数量性状基因座,它指的是控制数量性状的基因在基因组中的位置。对QTL的定位必须使用遗传标记,人们通过寻找遗传标记和感兴趣的数量性状之间的联系,将一个或多个QTL定位到位于同一染色体的遗传标记旁,换句话说,标记和QTL是连锁的。近几年QTL定位应用的较为广泛,在人类基因上与疾病有关的基因定位甚多;植物上,模式植物抗逆性基因的定位较多。
QTL 定位就是采用类似单基因定位的方法将QTL 定位在遗传图谱上,确定QTL 与遗传标记间的距离(以重组率表示)。根据标记数目的不同,可分为单标记、双标记和多标记几种方法。根据统计分析方法的不同,可分为方差与均值分析法、回归及相关分析法、矩估计及最大似然法等。根据标记区间数可分为零区间作图、单区间作图和多区间作图。此外,还有将不同方法结合起来的综合分析方法,如QTL 复合区间作图(CIM) 多区间作图(MIM) 、多QTL 作图、多性状作图(MTM) 等。