已经形成的氢键可以和葡萄糖苷酶反应吗
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发布时间:2022-07-15 23:49
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时间:2024-12-04 23:23
可以。葡萄糖苷酶来源广泛,几乎所有以碳水化合物为能源的具有细胞结构的生物体内都有所存在。根据具有糖类活性的酶数据库(Carbohydrate-ActiveenZYmesDatabase,CAZy)依据蛋白质晶体结构的同源性与功能的相似性所进行的归类,可将现已发现的糖苷水解酶分为133个糖苷水解酶家族(GH1~GH133),其中,葡萄糖苷酶主要分布在GH1、GH3、GH4、GH5、GH9、GH13、GH17、GH30、GH31、GH63、GH97、GH116与GH122等糖苷水解酶家族中。
大多数葡萄糖苷酶都是保留型葡萄糖苷酶,其催化机理通常都遵循“两步法”机制。第一步:作为亲核基团的羧基负离子亲核进攻糖苷键上的异头碳,同时作为广义酸碱对的另一个催化羧基上的氢与糖苷键上的氧原子形成氢键,第一次形成含氧碳正离子样过渡态(Oxocarbenium-liketransitionstate)。经过键的形成有断裂,糖基分子的异头碳构型发生第一次翻转,并与亲核羧基形成酯键,生成糖基-酶共价中间体,同时释放出一分子糖配基。第二步:糖基受体分子的活性羟基氢与发生解离的广义酸碱对羧基离子相互作用,同时受体分子的活性羟基氧亲核进攻糖基-酶共价中间体中糖基分子的异头碳,再次形成含氧碳正离子样过渡态,最终使得异头碳构型发生第二次翻转,并与受体羟基氧形成共价键,完成反应。