RR-B系剑尾鱼如何进行遗传纯合度检测?

发布网友发布时间：2023-04-24 13:18

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热心网友时间：2023-10-12 07:00

检测方法：
1、同工酶检测
以眼球为代表组织，进行聚丙烯酰胺凝胶电泳。结果显示，非选育红眼体红剑尾鱼个体间的乳酸脱氢酶（LDH）酶谱存在多态性；分析了30尾RR-B系20代个体，所有个体的LDH酶谱是一致的。
2、RAPD检测
通过对非选育剑尾鱼的RAPD扩增，从80条随机引物中筛选出29条多态性丰富的引物，用于RR-B系的RAPD检测。这些引物对RR-B系剑尾鱼个体的基因组DNA进行扩增，表明均有良好的扩增结果，共扩增出309条带，检测了12尾RR-B系剑尾鱼的309个位点，其中多态性条带29条，多态性条带频率在0%～50%之间，平均为9、48%。扩增片段的大小在0。2～3kb之间。
应用29条随机引物，对RR-B系剑尾鱼12尾个体基因组DNA进行扩增，根据RAPD谱带计算不同个体间的相似系数（S）和遗传距离（D）。从计算结果看，近交系剑尾鱼的遗传相似系数平均为0。9839（0。973～0。997），平均等位基因频率为0。8731，最低平均杂合率为0。1269、
3、微卫星检测
根据其中三个克隆的微卫星序列设计的引物扩增剑尾鱼基因组DNA，均扩增到目的片段，其大小分别为440bp、360bp和370bp。这三个克隆的序列已经登录在GenBank上，其登录号分别为AY204221、AY204222、AY204223、
根据所克隆筛选的三个微卫星标记（编号：AY204221、AY204222、AY204223）设计引物，分别对第19代RR-B系剑尾鱼个体和非选育剑尾鱼个体基因组DNA进行PCR扩增。结果这三个微卫星在非选育剑尾鱼中显示出多态性），而在19代RR-B系剑尾鱼中呈现单态。