化合物质谱数据怎么写的
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发布时间：2022-12-27 09:36
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时间：2023-10-19 15:35
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植物代谢组 | 一文了解用于质谱定性的代谢物数据库
4 个月前 · 来自专栏 代谢组及多组学技术
迈维代谢MetWare
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上期我们整体看了一下公共/自建数据库的类型，我们也能很清楚的发现，对于不同的数据库有着不同的用途，本期我们就具体来讲讲用于质谱数据匹配的数据库。(点此阅读原文）
1.NIST（National Institute of Standards and Technology）：包含气质平台30万+代谢物
NIST数据库是由美国国家标准技术研究院出版，一般与GC-MS平台配套使用。对于该数据库目前没有开放使用，但是网页版本的数据库开放使用，网页版本的可以看作是NIST的标准参考数据库Standard ReferenceData中一部分与化学有关的数据库的Web版本，可通过分子式检索、化学名检索、CAS登录号检索、离子能检索、电子亲和力检索、质子亲和力检索、酸度检索、表面活化能检索、振动能检索、电子能级别检索、结构检索、分子量检索和作者检索等方法，得到气相热化学数据、浓缩相热化学数据、相变数据、反应热化学数据、气相离子能数据、离子聚合数据、气相IR色谱、质谱、UV/Vi色谱、振动及电子色谱等。
网页链接：https://webbook.nist.gov/chemistry/
2. MassBank：包含来自气质液质不同平台不同模式共15055种物质
MassBank是一个高质量的质谱数据库，旨在公开分享从代谢物的化学标准品得到的质谱图以方便用户进行代谢物的鉴定，包含了代谢物的质谱信息以及采集情况，这些信息来自于不同的质谱仪设置，包括不同的电离技术，例如ESI、EI、 CI、APCI以及MALDI。
MassBank有三个不同的数据库：MassBank of North America (MoNa) 、the European MassBank 、the Japanese MSSJ MassBank，其中MoNa整合了更多来源的数据，因此相比其他两个更加受到科研工作者群体的偏好。
但是对于鉴定植物中的代谢物而言，MassBank中所包含的数据库是有限的，尤其是以质谱平台进行了*，用于检测植物的主要是液相质谱平台，其中使用较多的是以ESI离子源为主要类型，所有包含ESI离子源这种类型的数目加起来是11592个物质。
METLIN数据库中的质谱图可以与一些不同的质谱仪产生的谱图进行很好的匹配，包括了其中包括AB公司的 Triple TOF 5600，安捷伦的 6460 Triple Quad，Thermo的 Q-Exactive和 LTQ Orbitrap Velos（使用任何一种CID 或HCD碰撞形式）。该数据库的不足在于所有的数据不支持下载，必须在线查看，这也使得研究者不能使用这些二级碎片信息来开发新的检索工具或者应用工具。虽然如果实验室拥有安捷*司生产的质谱仪器，用户可以向生产商购买METLIN的数据库，但是购买的数据库的并不能跟网络数据库同步更新。安捷伦的METLIN个人数据库中（personalmetabolite database，PMD）中包含有9083个化合物，其中4165个为代谢物，其他的为二肽或者三肽。
热心网友
时间：2023-10-19 15:35
但是江湖中，质谱种类千千万，数据格式纷繁复杂，来自于质谱数据的难题困扰着每位欲要大展身手的“侠客”。亟需一种数据语言，统一规范各个设备的“话术”，让数据协作以及下游数据库共享分析得以更轻松，故此质谱数据标准化非常有意义。
01
变迁：笑傲江湖，以简驭繁
在2003-2005年，两种标准质谱数据格式初露头角。一种是由人类蛋白质组组织(Human Proteome Organization, HUPO)蛋白质组标准倡议(Proteomics Standards Initiative, PSI)开发的mzData格式，主要作为数据交换和归档格式。一种是由系统生物学研究所(Institute for Systems Biology, ISB)开发的mzXML格式，主要是为了简化数据处理软件。
这两种格式都被广泛使用，但是对于本质上相同的信息，使用两种格式会造成不必要的混淆，并增加软件开发复杂性。2006年春季，各个供应商在PSI会议上表达了他们对支持两种格式的不满，最终在PSI的倡议与支持下，2008年，第三种新的数据标准格式应运而生，它就是mzML 1.0.0。
热心网友
时间：2023-10-19 15:35
答案如下:首先第一步是写了开设置中心，二步是功效型号码是有什么是打开设没。
