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基因探针是 单链DNA吗

发布网友 发布时间:2022-04-23 13:09

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热心网友 时间:2022-05-07 03:49

不一定。
基因探针(probe)就是一段与目的基因或DNA互补的特异核苷酸序列,它可以包括整个基因,也可以仅仅是/基因的一部分;可以是DNA本身,也可以是由之转录而来的RNA。

1.探针的来源 DNA探针根据其来源有3种:一种来自基因组中有关的基因本身,称为基因组探针(genomic probe);另一种是从相应的基因转录获得了mRNA,再通过逆转录得到的探针,称为cDNa 探针(cDNa probe)。与基因组探针不同的是,cDNA探针不含有内含子序列。此外,还可在体外人工合成碱基数不多的与基因序列互补的DN*段,称为寡核苷酸探针。

2.探针的制备 进行分子突变需要大量的探针拷贝,后者一般是通过分子克隆(molecular cloning)获得的。克隆是指用无性繁殖方法获得同一个体、细胞或分子的大量复制品。当制备基因组DNA探针进,应先制备基因组文库,即把基因组 DNA打断,或用*性酶作不完全水解,得到许多大小不等的随机片段,将这些片段体外重组到运载体(噬菌体、质粒等)中去,再将后者转染适当的宿主细胞如大肠肝菌,这时在固体培养基上可以得到许多携带有不同DN*段的克隆噬菌斑,通过原位杂交,从中可筛出含有目的基因片段的克隆,然后通过细胞扩增,制备出大量的探针。

为了制备cDNA 探针,首先需分离纯化相应mRNA,这从含有大量mRNA的组织、细胞中比较容易做到,如从造血细胞中制备α或β珠蛋白mRNA。有了mRNA作模板后,在逆转录酶的作用下,就可以合成与之互补的DNA(即cDNA),cDNA与待测基因的编码区有完全相同的碱基顺序,但内含子已在加工过程中切除。

寡核苷酸探针是人工合成的,与已知基因DNA互补的,长度可从十几到几十个核苷酸的片段。如仅知蛋白质的氨基酸顺序量,也可以按氨基酸的密码推导出核苷酸序列,并用化学方法合成。

3.探针的标记为了确定探针是否与相应的基因组DNA杂交,有必要对探针加以标记,以便在结合部位获得可识别的信号,通常采用放射性同位素32P标记探针的某种核苷酸α 磷酸基。但近年来已发展了一些用非同位素如生物素、地高辛配体等作为标记物的方法。但都不及同位素敏感。非同位素标记的优点是保存时间较长,而且避免了同位素的污染。最常用的探针标记法是缺口平移法(nick translation)。首先用适当浓度的DNA酶Ⅰ(DNAseⅠ)在探针DNA双链上造成缺口,然后再借助于DNA聚合酶Ⅰ(DNa poly merasⅠ)的5’→3’的外切酶活性,切去带有5’磷酸的核苷酸;同时又利用该酶的5’→3’聚酶活性,使32P标记的互补核苷酸补入缺口,DNA聚合酶Ⅰ的这两种活性的交替作用,使缺口不断向3’的方向移动,同时DNA链上的核苷酸不断为32P标记的核苷酸所取代。

探针的标记也可以采用随机引物法,即向变性的探针溶液加入6个核苷酸的随机DNA小片段,作为引物,当后者与单链DNA互补结合后,按碱基互补原则不断在其3’OH端添加同位素标记的单核苷酸,这样也可以获得比放射性很高的DNA探针。

热心网友 时间:2022-05-07 05:07



探针(probe)
段与目

或DNA互补
特异核苷酸序列
包括整

仅仅
/基


DNA本身

转录
RNA
1.探针

DNA探针根据其

3种:

自基



本身


组探针(genomic
probe);另

相应

转录获
mRNA
再通
逆转录
探针

cDNa
探针(cDNa
probe)
与基
组探针

cDNA探针

内含
序列

体外
工合
碱基数
与基
序列互补
DN*段

寡核苷酸探针
2.探针
制备
进行
突变需要

探针拷贝



克隆(molecular
cloning)获
克隆
指用
性繁殖


体、细胞或
量复制品
制备基
组DNA探针进
应先制备基
组文库



DNA打断
或用*性酶作
完全水解


随机片段
些片段体外重组
运载体(噬菌体、质粒等)

者转染适
宿主细胞
肠肝菌
固体培养基

携带
同DN*段
克隆噬菌斑

原位杂交




片段
克隆

细胞扩增
制备

探针
制备cDNA
探针
首先需
离纯化相应mRNA

量mRNA
组织、细胞
比较容易做
造血细胞
制备α或β珠蛋白mRNA
mRNA作模板
逆转录酶
作用


互补
DNA(即cDNA)
cDNA与待测基
编码区
完全相同
碱基顺序
内含

加工

切除
寡核苷酸探针
工合
与已知基
DNA互补

十几
几十
核苷酸
片段
仅知蛋白质
氨基酸顺序量
按氨基酸
密码推导
核苷酸序列
并用化

3.探针
标记
确定探针
否与相应

组DNA杂交
必要
探针加
标记
便
结合部位获
识别
信号,通
采用放射性同位素32P标记探针
某种核苷酸α
磷酸基

已发展
些用非同位素
物素、
高辛配体等作
标记物

及同位素敏
非同位素标记
优点
保存
间较
,
且避免
同位素
污染

探针标记
缺口平移
(nick
translation)
首先用适
浓度
DNA酶Ⅰ(DNAseⅠ)
探针DNA双链

缺口
再借助于DNA聚合酶Ⅰ(DNa
poly
merasⅠ)
5’→3’
外切酶



5’磷酸
核苷酸;同
利用该酶
5’→3’聚酶

使32P标记
互补核苷酸补入缺口
DNA聚合酶Ⅰ
两种

交替作用
使缺口
断向3’
向移

DNA链
核苷酸

32P标记
核苷酸所取代
探针
标记
采用随机引物
即向变性
探针溶液加入6
核苷酸
随机DNA
片段

引物
者与单链DNA互补结合
按碱基互补原则

其3’OH端添加同位素标记
单核苷酸

比放射性

DNA探针

热心网友 时间:2022-05-07 06:42

探针分好几种,不一定的

热心网友 时间:2022-05-07 08:33

不一定
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