如何查找基因序列的抑制剂或拟似物

发布网友发布时间：2022-05-04 12:58

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热心网友时间：2022-06-22 03:00

Bioedit提供了本地blast工具（菜单里的local blast 功能）,如图一. 你需要把基因组数据做成本地数据库,使用菜单里的create a local nucleotide database file功能建立本地DNA数据库,建库的原始数据需要做成fasta格式的,建成的数据库存放在...\bioedit\database文件夹里. 然后用另一种菌的基因序列和基因组本地数据库做blastn或者tblastx（图二）,就能找到与这个基因序列相似性较高的contig了. 我的bioedit版本较低,估计也能参考吧. 也可以直接从NCBI下载本地blast相关程序,使用dos命令行操作.

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